Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MYOFQ9NZM1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms