Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPG21Q9NZD8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms