Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms