Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARHGEF38Q9NXL2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms