Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM28Q9NW13 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBM28Q9NW13 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms