Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL11Q9NVR0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms