Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms