Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB4Q9NTQ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms