Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms