Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOMER3Q9NSC5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HOMER3Q9NSC5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOMER3Q9NSC5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms