Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKN1Q9NS71 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms