Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ARHGAP35Q9NRY4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
ARHGAP35Q9NRY4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARHGAP35Q9NRY4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms