Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6BQ9NRW1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6BQ9NRW1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms