Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPHK2Q9NRA0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK2Q9NRA0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK2Q9NRA0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms