Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR8Q9NR97 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLR8Q9NR97 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLR8Q9NR97 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR8Q9NR97 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR8Q9NR97 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR8Q9NR97 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR8Q9NR97 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR8Q9NR97 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TLR8Q9NR97 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms