Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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