Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC177Q9NQR7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC177Q9NQR7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms