Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEPEQ9NQ76 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEPEQ9NQ76 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms