Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MID1IP1Q9NPA3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID1IP1Q9NPA3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID1IP1Q9NPA3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms