Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB18Q9NP72 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms