Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGAP3Q9NP61 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGAP3Q9NP61 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms