Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XAB2Q9HCS7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
XAB2Q9HCS7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms