Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDFQ9HBH1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms