Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAS3Q9H6U6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAS3Q9H6U6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAS3Q9H6U6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms