Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.6 ms