Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNMDQ9H2S6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNMDQ9H2S6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms