Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIOBPQ9H2D6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms