Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC90BQ9GZT6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC90BQ9GZT6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms