Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YIPF3Q9GZM5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms