Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXP3Q9BZS1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXP3Q9BZS1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms