Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCO2Q9BYV7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BCO2Q9BYV7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCO2Q9BYV7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms