Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms