Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf43Q9BWL3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf43Q9BWL3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms