Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP8Q9BV40 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP8Q9BV40 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms