Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms