Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf16Q9BUW7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf16Q9BUW7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms