Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYT11Q9BT88 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT11Q9BT88 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms