Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C16orf70Q9BSU1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C16orf70Q9BSU1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms