Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK0

MARVELD1, MARVEL domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD1Q9BSK0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MARVELD1Q9BSK0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MARVELD1Q9BSK0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms