Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRADC1Q9BSG0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRADC1Q9BSG0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms