Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC77Q9BR77 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC77Q9BR77 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms