Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3GL2Q99962 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GL2Q99962 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms