Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DUSP9Q99956 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DUSP9Q99956 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms