Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID3AQ99856 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3AQ99856 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms