Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS2Q99743 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS2Q99743 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms