Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPAS1Q99742 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms