Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD1Q99460 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD1Q99460 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMD1Q99460 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMD1Q99460 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMD1Q99460 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMD1Q99460 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMD1Q99460 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PSMD1Q99460 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PSMD1Q99460 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMD1Q99460 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD1Q99460 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD1Q99460 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD1Q99460 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD1Q99460 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD1Q99460 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD1Q99460 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD1Q99460 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PSMD1Q99460 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PSMD1Q99460 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSMD1Q99460 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD1Q99460 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms