Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYCBPQ99417 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYCBPQ99417 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms