Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC6Q96SB8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC6Q96SB8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms