Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms